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Von klein auf liebte und beobachtete Hebel die Natur: die Pflanzen und Tierwelt, Sonne Mond und Sterne. Von Förderern finanziell unterstützt konnte er 1774 das Karlsruher Gymnasium besuchen und anschließend Theologie und im Rahmen dieses Studiums auch Alte Sprachen.studieren. Neben der Lehrtätigkeit am Gymnasium in Karlsruhe, dessen Direktor er 1808 wurde, predigte er auch gelegentlich bei Hofe. Hebel unterrichtete mehrere Unterrichtsfächer, darunter auch Botanik und Naturgeschichte; an der Karlsruher Hochschule hatte er eine Professor für Hebräisch, Latein, Griechisch und Naturwissenschaften.
Bekannt ist, daß eine eine Pflanzensammlung besaß, die er in einem umfangreichen Herbarium zusammengefasst hatte. Hebel war mit dem Botaniker Karl Christian Gmelin befreundet, dessen „Flora badensis alsatica“ er bezüglich der botanischen (lateinischen und griechischen) Bezeichnungen und Diagnosen überarbeitete. Gmelin seinerseits nahm in diesem Werk die Simsenlilie unter dem Namen Hebelia allemannica (heute Tofieldia calyculata) auf.