Seit den siebziger Jahren setzt sie sich für die Botanischen Gärten ein als wichtige Institutionen zur Erforschung und Erhaltung biologischer Vielfalt und als Standorte zur Kommunikation der ethischen Verantwortung des Menschen für den Erhalt des Naturerbes. Zu Beginn der achtziger Jahre startete sie eine Initiative, Samen von Wildpflanzen zu sammeln und in einer Genbank zu hinterlegen.Im Rahmen ihres Engagements für die Botanischen Gärten initiierte sie im Jahr 1986 den internationalen Gärtnertausch, der zunächst von der Stiftung Natur und Pflanzen betreut und seit kurzem durch eine eigene Stiftung finanziert wird (Stiftung Internationaler Gärtnertausch). Hierin sind gegenwärtig die Botanischen Gärten in Hamburg, Jerusalem (Israel), Sankt Petersburg (Russland), Mérida (Venezuela), Göteborg (Schweden) und Mexico City miteinander verbunden, zwischen denen bisher weit über 50 gegenseitige Arbeitsaufenthalte von Gärtnern durchgeführt wurden. In Anerkennung dieses Engagements verlieh die Russische Akademie der Wissenschaften in Sankt Petersburg Loki Schmidt 1997 die Ehrendoktorwürde für ihre Förderung der Botanik und der Bildung.
1997 veröffentlichte sie in einem viel gelobten Bildband die erste vollständige Übersicht der teilweise weltweit bedeutenden Sammlungen der Botanischen Gärten Deutschlands: Die Botanischen Gärten in Deutschland im Hoffmann und Campe Verlag. Um ihn zu erstellen, hat sie alle 70 botanischen Gärten der Republik abgeklappert und dabei 26000 Reisekilometern in fast zweijähriger Recherchearbeit zurückgelegt. Der Erlös geht an " ihre" Stiftung. 

1976 gründete Loki Schmidt die Stiftung zum Schutze gefährdeter Pflanzen. Der jährlich erscheinende Kalender, ebenfalls ihre Idee, diente und dient heute noch der Förderung des Bekanntheitsgrades der Stiftung und der Einwerbung von Spenden. Ebenfalls um Gelder hereinzubekommen, schuf sie die Wandteller "Geschützte Pflanzen", die bei der Porzellanmanufaktur Rosenthal hergestellt wurden.Um den Schutz der bedrohten Pflanzenarten zu unterstützen, hat der Heidelberger Künstler Carl-Alois Sambale für die Majolika Keramik Manufaktur Karlsruhe eine exklusive und limitierte Kunst-Weinkühler-Edition angefertigt und mit den "Preisträgerinnen" verziert. Als am 14. Oktober 2004 die Blume des Jahres 2005 präsentiert wurde, weilten der Künstler Alois Sambale und die Leiterin der Majolika Galerie Martina Bayne in Hamburg und überreichten gemeinsam exklusiv den Weinkühler 2005 an Loki Schmidt. 

Die Idee, diejenigen, die dazu beitragen, gefährdete Pflanzen zu schützen, mit einer Silberpflanze zu würdigen, hatten Loki Schmidt und der Hamburger Industrielle Dr. Kurt A. Körber. Seit 1977 verleiht Frau Loki Schmidt auf Empfehlung der Stiftung die 25 Zentimeter große Plastik des Hamburger Künstlers Helmut Koniarsky - eine stilisierte Pflanze aus reinem Silber- an Einzelpersonen, Gruppen oder Institutionen, die sich um die Erhaltung gefährdeter Pflanzen und gefährdeter Biotope besonders verdient gemacht haben.Als Symbol für den Schutz unserer Pflanzenwelt schuf der. Die "Silberpflanze" ist bei Pflanzenschützern und umweltbewussten Bürgern eine begehrte Auszeichnung.
Die Stiftung wurde später mit der Stiftung Naturschutz Hamburg (gegründet 1985/1986 unter maßgeblicher Beteiligung des damaligen Präses der Hamburger Umweltbehörde und heutigen Stiftungsratsvorsitzenden Senator a. D. Wolfgang Curilla) zur Stiftung Naturschutz Hamburg und Stiftung zum Schutze gefährdeter Pflanzen fusioniert. Durch etliche Projekte trug sie dazu bei, u. a. auch bedrohte Lebensräume zu retten, in dem sie die Grundstücke aufkaufte - wie beispielsweise der Flächenkäufe zur Rettung der Wildnarzissen im Oleftal bei Hollerath in der Eifel . Auch das Projekt Apfelgärten im Seewind, ein Projekt der Umwelterziehung Iffens e.V., gehört dazu. 

Bereits lange vor der Internationalen Umweltkonferenz in Rio de Janeiro (1992) hat Hannelore Schmidt wissenschaftliche Schutzkonzepte für gefährdete Pflanzen und ganze Ökosysteme gefordert. Ihre vorausschauende wissenschaftliche Aktivität ist besonders deutlich auch in dem vor ihr betreuten, bereits vor mehr als 20 Jahren eingerichteten 6,5 Hektar umfassenden Naturschutzbeobachtungsgebiet am Brahmsee in Schleswig-Holstein dokumentiert. 

Seit 1980 stellt sie jeden Herbst die "Blume des Jahres" vor, seltene und gefährdete Pflanzen, deren Lebensräume bedroht sind. Inzwischen gibt es etliche Nachfolger: Schmetterling des Jahres, Vogel des Jahres, Flusslandschaft des Jahre, Giftpflanze des Jahres, Gefährdete Nutztierrasse des Jahres, Spinne des Jahres usw. usw. - unter dem Schutzmantel des Naturschutzbundes. oder des Kuratoriums Baum des Jahres

Nach 1982 bekam sie eine Auszeichnung nach der anderen. Zu ihrem 80. Geburtstag erhielt sie 1999 für ihre Verdienste um den Pflanzen- und Naturschutz von der Universität Hamburg den Professorentitel, am 6. Juli 2000 wird ihr eine zweite Auszeichnung der Universität Hamburg zuteil.Der Fachbereich Biologie erteilt ihr den Grad eines Doktors der Naturwissenschaften ehrenhalber. 

2005 hat sich Loki Schmidt, Ehefrau des früheren Bundeskanzlers Helmut Schmidt, in die aktuelle Bildungsdebatte eingemischt. "Mein Leben für die Schule" lautet der Titel ihres soeben erschienenen Buches, in dem sie über ihre Erfahrungen als Lehrerin, die Konsequenzen aus PISA und die Grenzen der Pädagogik schreibt. Im Gespräch mit dem Erziehungswissenschaftler Reiner Lehberger, mit dem sie seit vielen Jahren in Schulprojekten zusammenarbeitet, analysiert Loki Schmidt nicht nur tiefenscharf unser Bildungselend, sondern reflektiert auch ihre eigene Schulzeit, als sie und Helmut sich als Pennäler kennen lernten. Damit knüpft sie an ihre viel beachtete Autobiografie "Loki - Hannelore Schmidt erzählt aus ihrem Leben" an.

Loki Schmidt ist immer noch aktiv, jüngstes Beispiel im Jahr 2006: 
"Zu den wenigen Standorten, an denen es in Deutschland eine der lange Zeit für fast ausgestorben gehaltenen Wollemi-Pine zu sehen gibt, gehört seit Mitte Mai 2006 auch der Botanische Garten Hamburg. Prof. Loki Schmidt, Ehefrau des ehemaligen Bundeskanzlers Helmut Schmidt, zeigte sich begeistert und legte bei der Pflanzung der 1,60 Meter großen Attraktion selbst mit Hand an. Loki Schmidt nahm außerdem als Schirmherrin der Stiftung Naturschutz Hamburg zusammen mit dem Geschäftsführer der Stiftung, Dr. Johannes Martens, für die Stiftung einen Scheck über 9900 australische Dollar (rund 5800 Euro) aus der Versteigerung erster Nachzuchten der Wollemi-Pine, übergeben von Garry Grüber sowie Alexander Kientzler (beide vom Züchtungshaus Kientzler), entgegen. Hiermit sollen Grundstücke in Deutschland, an denen bedrohte Pflanzenarten vorkommen, erworben und langfristig geschützt werden". (Quelle)

"Mit ihrer Öffentlichkeitsarbeit hat sie mehr für die Botanik bewirkt als so manches Dutzend Biologieprofessoren" (Die Zeit 1999).